С середины 90-х гг. в практической медицине стал широко применяться новый диагностический подход, основанный на применении метода ПЦР (полимеразная цепная реакция).
На данный момент в России и странах СНГ активно функционируют более 1000 лабораторий, применяющих на практике метод ПЦР. За этот период метод ПЦР как один из методов клинической лабораторной диагностики прошел несколько этапов развития, в том числе несколько этапов становления и утверждения в практическом здравоохранении.
Некоторое время тому назад, среди медицинской общественности было широко распространено несколько эйфорическое отношение к ПЦР-методу, как к некоей панацее, «самому-самому» методу диагностики, способному решить сразу много вопросов и применимому во всех областях.
Через определенное время стало понятно, что ПЦР – всего лишь один из методов лабораторной диагностики, но даже новый замечательный метод, имеющий много преимуществ, не может решить всех проблем, и кроме того, имеет ряд существенных ограничений. Помимо всего, как грибы стали возникать фирмы и лаборатории, выпускающие наборы реагентов для ПЦР, зачастую не отвечающие требованиям по качеству, а широкомасштабная неумелая реклама только усилила эффект последующего разочарования. Эти обстоятельства привели к тому, что в некоторых кругах региональной медицинской общественности метод ПЦР (а точнее его первоначальное практическое воплощение) до сих пор ассоциируется с какой-то разновидностью шарлатанства.
Однако, к настоящему моменту метод ПЦР:
-занял прочную позицию в ряду диагностических методик;
-получил официальное признание в виде утвержденной номенклатуры клинических лабораторных исследований;
-претерпел существенные изменения в области оптимизации проведения анализа, усовершенствования аппаратурного оборудования, повышения качества и надежности выпускаемых тест-систем.
Методы выявления ДНК и РНК-возбудителей в настоящее время применяют в основном для диагностики вирусных инфекций. Методы генной диагностики базируются на выявлении нуклеотидных последовательностей непосредственно в патологическом материале с помощью молекулярных зондов — искусственно полученных нуклеиновых кислот, комплементарных вирусным нуклеиновым кислотам и меченных биотином или радиоактивной меткой.
Особенность метода ПЦР — многократное копирование (амплификация, репликация, удвоение) с помощью фермента ДНК-полимеразы определённого фрагмента ДНК, состоящего из нескольких десятков или сотен нуклеотидных пар, который уникален, то есть специфичен для данного вида возбудителя. Механизм репликации таков, что достраивание фрагмента может начаться только в определённых стартовых блоках, для создания которых в заданных участках ДНК используют затравки (праймеры) — специально синтезированные олигонуклеотиды. Праймеры комплементарны последовательностям в пределах границ специфического фрагмента, и синтез ДНК протекает только в этих границах. Специфичность метода определяется выбором определяемого фрагмента (как правило, выбирается наиболее консервативный участок генома возбудителя, не подверженный мутациям) и подбором олигонуклеотидных затравок (праймеров) к границам искомого фрагмента. Специфичность декларируется производителем тест-системы как одна из важнейших характеристик.
Процесс ПЦР заключается в большом числе циклов синтеза (амплификации) специфического фрагмента ДНК, накоплении большого числа копий, которые затем могут быть выявлены обычными методами детекции (иммунофлюоресцентный анализ, электрофорез).
Преимущества ПЦРдиагностики:
●простота исполнения;
●возможность полной автоматизации;
●быстрота получения результата;
●малое количество патологического материала, необходимого для исследования;
●возможность диагностики острых, хронических, латентных инфекций;
●выявление некультивируемых, персистирующих форм патогенов.
По чувствительности ПЦР наиболее совершенен как диагностический метод (на несколько порядков выше, чем другие тесты). Специфичность метода также высока, но пока большинство тест-систем недостаточно надёжны, чтобы вытеснить классические методики при диагностике даже абсолютных патогенов.
Что касается оппортунистических инфекций, то значение молекулярно-генетических методов диагностики пока нельзя признать сколько-нибудь значимыми, так как определяющим моментом в развитии таких воспалительных процессов служит количественный фактор, а не само по себе присутствие микроорганизма в обследуемом локусе.
В настоящее время ПЦР-методы широко используют в диагностике вирусных, паразитарных и бактериальных ИППП, чаще в качестве первичного скрининга, а также контроля излеченности в сочетании с другими методами лабораторной диагностики.
Каково же на современном этапе положение метода ПЦР в ряду лабораторных диагностических методик:
Задачей метода ПЦР является выявление специфического участка ДНК или РНК путем получения большого количества копий данного участка, которые можно определить доступными лабораторными методиками. Несмотря на достаточно широкий круг возможного использования (диагностика наследственных заболеваний, идентификация личности, определение комплексов гистосовместимости тканей и др.), в основном метод ПЦР нашел применение для выявления возбудителей инфекционных заболеваний.
Такое широкое применение именно для диагностики инфекций обусловлено:
1. простотой и универсальностью метода;
2. возможностью определения возбудителя с очень высокой специфичностью (до 100%), т.е способностью выявлять ДНК только искомого микроорганизма в клиническом образце, содержащем большую нагрузку по человеческой ДНК, ДНК других возбудителей, белкам и пр.
3. высокой чувствительностью, которая обеспечивает возможность выявления единичных клеток или частиц возбудителя.
Добавить комментарий